В своей деятельности Отдел руководствуется Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами, федеральными законами, актами Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации, актами Минюста России, ФСИН России, международными договорами Российской Федерации, иными нормативными правовыми актами Российской Федерации.
Организационно-методическое обеспечение деятельности учреждений и органов уголовно-исполнительной системы по вопросам, относящимся к компетенции Отдела. Соблюдение сроков рассмотрения письменных обращений граждан, предложений, заявлений и жалоб осужденных и лиц, содержащихся под стражей, принятие по ним соответствующих решений и направление ответов в установленный законодательством Российской Федерации срок.
Участие в подготовке проектов федеральных законов, межгосударственных договоров и соглашений, постановлений и распоряжений Правительства Российской Федерации, приказов, распоряжений и указаний Минюста России, ФСИН России по вопросам, связанным с деятельностью исправительных учреждений.
Основными функциями Отдела являются:
Контроль за деятельностью подразделений специального учета территориальных органов ФСИН России, исправительных учреждений и следственных изоляторов по соблюдению законности и обеспечению прав осужденных и лиц, содержащихся под стражей. Подготовка предложений по совершенствованию законодательства Российской Федерации по вопросам, входящим в компетенцию Отдела.Подготовка проектов актов Минюста России и ФСИН России по вопросам, входящим в компетенцию Отдела. Разработка и обеспечение единого подхода к организации деятельности учреждений и органов УИС по вопросам, входящим в компетенцию Отдела. Своевременное и в полном объеме рассмотрение обращений осужденных и лиц, содержащихся под стражей, иных граждан по вопросам, входящим в компетенцию Отдела, принятие по ним соответствующих решений и направление ответов в установленный законодательством Российской Федерации срок. Выявление, обобщение и внедрение в практику деятельности УИС передовых форм и методов работы, подготовка предложений в планы работы проектных и научно-исследовательских учреждений УИС, направленных на решение задач Управления.